眼球的后段通过保持眼球的形状，使镜片保持在适当的位置，并且从眼睛后面的感光细胞引发对大脑的神经冲动起作用。
视网膜 ， 脉络膜 （眼睛的血管层）和视神经包含大部分后段，在这些眼层中存在许多与HIV相关的病症 ，更常见于晚期HIV病。
后段病变主要表现为视网膜血管改变，多达50％至70％的HIV感染患者可见，有时可导致视网膜持续或急性损伤（称为视网膜病变）。
其他与HIV相关的后段感染包括：
巨细胞病毒
巨细胞病毒（CMV）是一种疱疹病毒，感染超过一半的成年人群体，很少在具有合格免疫系统的患者中表现出疾病（除偶尔具有单核细胞增多症样症状外）。 虽然它通常是从母亲到婴儿的围产期通过，但它也可以通过性接触在成年期传播。 因此，男男性接触者中CMV患病率约为90％，与艾滋病晚期患者相同。
CMV可以以多种方式呈现在眼睛中，尽管它最常见的是伴随着视网膜有时令人虚弱的炎症，简称为视网膜炎。 这种疾病最常发生在CD4计数低于50个细胞/ mL的患者身上，并表现出从浮游物感知到视觉丧失乃至失明的症状。
一旦在视网膜上发现CMV病变，它们通常可在数周内快速进展。 如果没有医学干预，病变可以离心进行（从中心向外扩张），视力减弱，有时导致视力完全丧失。 虽然CMV视网膜炎通常呈双侧（双眼），但也可单侧呈现（单眼）。
缬更昔洛韦被认为是治疗CMV视网膜炎的首选药物，在诱导期内口服给药，每日两次，随后在维持期内每日服用一次。 更昔洛韦也可以开处方，但静脉注射，而不是口服，约21天。
或者，玻璃体内更昔洛韦植入物 - 从字面上看，直接递送到感染部位的微量注射棒 - 有时会插入眼内。 通常用于CMV视网膜炎的更深层次的病例，它可以延长玻璃体液中持久的药物浓度（透明凝胶填充晶状体和视网膜之间的空间）。
弓形虫
弓形虫是普通人群中视网膜脉络膜炎（视网膜和/或脉络膜感染）的最常见原因，在艾滋病毒感染者中是第二常见原因。
由原生动物寄生虫弓形虫引起的这种疾病每年在美国影响超过20万人，并且通过围产期或通过摄取受污染的肉来传播。 通常与猫有关（尽管它存在于许多温血动物中），与猫粪接触也被认为是弓形虫传播的重要原因。
当弓形体病出现在眼中时，它表现为伴有玻璃体液炎症的黄白色至浅灰色病变。 鉴别通常可以通过眼科检查进行，基于抗体的血液检查可以提供血清学证实。
局部使用类固醇有时用于治疗弓形体视网膜脉络膜炎较轻的病例，而更严重的病例常常使用乙胺嘧啶，亚叶酸和磺胺嘧啶的组合。 对于艾滋病晚期患者，可能需要持续的慢性治疗，通常使用甲氧苄氨嘧啶 - 磺胺甲恶唑，其组合通常具有良好的耐受性。
隐球菌
隐球菌病是由吸入空气传播的隐球菌新型隐孢子虫孢子引起的感染，其通常可能与脑膜炎（围绕大脑和脊髓的保护性膜有时危及生命的炎症）表现出来。 在严重的隐球菌性脑膜炎发作期间，尤其是伴有败血症时，大多数眼部受累作为次要表现发展。
当疾病传播（即扩散超过源感染）时，眼部感染可以通过中枢神经系统（CNS）通过视神经或通过血流传播。
在检查时，可以在脉络膜和/或视网膜上发现多个黄色病灶。 如果不治疗，感染向视神经组织传播有时会导致视力丧失。
一般通过静脉注射两性霉素B和氟胞嘧啶来治疗隐球菌性脑膜炎，这被认为是治疗的选择。 当疑似眼部受累时，也常常开具抗真菌药物 。
结核
结核病（TB）往往不如其他艾滋病毒相关性眼病，但在有活动性肺结核的HIV患者中有时可见。 它倾向于在脉络膜上表现为结节样肉芽肿，并且可以表现出比其他HIV相关的后段感染更高的CD4计数（大于150个细胞/ mL）。 通常将抗结核药物全身治疗作为建议的疗程。
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