植物区系是一组植物或细菌生命的科学术语，通常特定于某个区域。 它通常与用来描述同一特定区域的动物生活的术语“动物群”形成对照。 在健康和医学领域，菌群是用来描述人体内或体内存在的微生物的术语，如肠道菌群或皮肤菌群。
当谈到人体环境中的植物群时，这个术语指的是细菌，酵母和其他真菌。
概观
肠道菌群是指居于我们肠道的微生物世界，主要是细菌。 研究越来越集中于试图理解肠道菌群在人类健康方面的作用。 多种名称用于指代这种内部微生物群体：
- 肠道细菌
- 肠道菌群
- 微生物群
- 微生物
- 菌群
它变得非常明显，肠道菌群在我们的健康和我们对疾病的脆弱性中起着重要作用。
发展
婴儿出生的肠道被认为是完全或大部分是无菌的。 当他们经过他们母亲的产道时，他们会接触到她的阴道微生物，这是微生物群体的起源。 微生物组的进一步居住环境暴露和摄入母乳，配方和最终的食物。
这是填充通过剖宫产出生的婴儿的微生物群的因素。 肠道菌群的构成在我们的整个生命周期中继续演变。
位置
通过消化过程分泌的物质对肠道细菌增殖的位置有影响。 胃酸，胆汁酸和胰腺酶通常阻止细菌在胃或小肠的起始部分定植。
（ 小肠细菌过度生长是一种健康问题，在小肠中发现多余的细菌）。因此，在你的小肠的最后部分发现肠道细菌，但是在你的大肠中发现了一定程度的肠道细菌。 据估计，你身体内有超过千种类型的微生物，这些微生物占大约60％的粪便。 这个世界的微生物通过大肠上的单层细胞（称为上皮细胞）从体内分离出来。
功能
如上所述，你的肠道菌群是你健康的关键人物。 两个最重要的角色与免疫系统保护和新陈代谢有关。 对于这些重要的功能，需要有一个“友好”细菌的最佳优势。 让我们依次看看这些函数中的每一个：
支持免疫系统
似乎有两种我们的肠道细菌支持我们的免疫系统的方式。 首先，有益的细菌为我们大肠的内层提供直接保护，排除对我们有害的物质。 当这个系统受到损害时，可能会出现肠通透性增加的状态（漏肠综合征）。
第二种是有利的肠道细菌与我们肠道内的免疫系统一起工作，以“抵抗”引起疾病的细菌或其他物质。
有用的代谢作用
我们的肠道菌群在为我们提供维生素和其他对我们健康至关重要的营养素方面发挥着重要作用。 微生物组还可与未在小肠中消化的碳水化合物（如抗性淀粉和FODMAPs ） 相互作用 ，从而提供进一步的营养，促进上皮细胞生长并调节脂肪储存。
相关的健康问题
现在认识到，低于肠道菌群的最佳组成可能导致健康问题，无论是消化系统还是非消化系统。
目前似乎与肠道菌群的不健康平衡直接相关的健康问题包括以下内容：
自我护理
保持压力，抗生素使用量降到最低，吃全面营养的食物，包括被认为是益生元的食物，都有可能优化肠道菌群。 此外，虽然益处远未得到证实，但益生菌可能有帮助，通常不会使事情变得更糟。 被称为粪便微生物群移植的程序似乎在极端情况下对增强肠道菌群的健康具有一定的希望。
资料来源：
Bull，M.＆Plummer，N。“Part 2：Treatments for Chronic Gastrointestinal Disease and Gut Dysbiosis” Integrative Medicine：A Clinician's Journal 2015 14：25-33。
Bull，M.＆Plummer，N。“Part 1：The Human Gut Microbiome in Health and Disease” Integrative Medicine：A Clinician's Journal2014 13：17-22。
O'Hara，A.＆Shanahan，F。“肠道菌群作为一个被遗忘的器官” EMBO Reports 2006 7：688-693。