南美锥虫病的诊断取决于感染是急性的，慢性的还是先天性的。
诊断急性恰加斯病
诊断恰加斯病的最佳时间是在疾病的急性阶段，当时根除克氏锥虫（T. cruzi）感染抗肿瘤药物的机会最高。
不幸的是，这个机会往往被错过。
这是因为由恰加斯病急性发作引起的症状通常是轻微的，并不是特别惊人，所以患有急性查加斯的人通常不会寻求医疗帮助。
居住在流行地区的人们应该注意南美锥虫病的潜在症状 ，特别是如果他们注意到特别突出或持久的昆虫叮咬，或者他们知道在他们地区爆发南美锥虫病。 如果他们怀疑他们应该去看医生。
至于医生，重要的是他们仍然怀疑可能存在恰加斯病，然后进行必要的诊断测试。 在实际操作中，这种情况通常只发生在公认的本地暴发期间，当时开展了全社区筛查。
做出诊断
在恰加斯病的急性期，血液中的克氏锥虫寄生虫数量通常很高。 这可以通过在显微镜下检查特制的血液样本来进行Chagas的诊断。
然而，即使没有给予治疗，在头90天后，血液中克氏锥虫的数量迅速下降。 在这段时间之后，血液的显微镜检查不再是诊断恰加斯病的可靠手段。 在恰加斯的慢性阶段，显微镜测试几乎没有用。
除显微镜检查外，实验室血液检测在诊断急性恰加斯病方面也是非常准确的。 这是通过聚合酶链式反应（PCR）检测 ，检测血液样品中克氏锥虫的DNA。 像显微镜检测一样，阳性PCR检测表明克氏锥虫生物体存在于血流中。
与急性查加斯病相关的症状（如虚弱，发热，喉咙痛，皮疹和肌肉疼痛）很容易与感染性单核细胞增多症或急性HIV感染的症状混淆。 因此，当生活在南美锥虫病流行地区的人正在接受这些疾病的任何一种检测时，通常也是检测克氏锥虫感染的好主意。
诊断慢性查加斯病
在慢性恰加斯病中，克氏锥虫生物体通常不再存在于血流中，因此血液样品的显微测试几乎总是阴性的，PCR检测也是如此。
诊断慢性查加斯病通常依靠检测身体制造的抗体来抵抗感染。 已经开发了许多测试来寻找克氏锥虫的抗体，包括酶联免疫吸附测定（ELISA）和免疫荧光抗体测定（IFA）。
这些抗体测试都不够准确，无法自行使用，因此为了诊断慢性查加斯病，通常至少进行两次不同的抗体测试 - 如果测试结果不同，则第三次测试作为打破平局。
同时，还应进行检测以寻找与慢性南美锥虫病有关的各种心脏和肠胃问题的其他潜在原因。 可以做到这一点的条件不幸很长，医生必须在决定做什么测试以及按照什么顺序决定做出很多临床判断。
诊断先天性锥虫病
多达10％的感染克氏锥虫的母亲所生的婴儿会发生急性恰加斯病 - 一种称为先天性锥虫病的疾病。 患有先天性锥虫病的婴儿接受抗肿瘤治疗以预防慢性并发症是很重要的。
在母亲来自疾病流行地区的新生儿中，应考虑到先天性锥虫病的可能性。 产前检查通常在生活在这些地区的孕妇中进行，然后可以对检测结果为阳性的母亲的婴儿进行筛查。
婴儿自己筛查先天性锥虫病通常是在出生时用脐带血PCR检测或在出生后头几天内获得的血液样本进行。 如果已知母亲对南美锥虫病有积极作用，并且对婴儿的初步筛查结果为阴性，则应在一两个月后重复对婴儿进行检测。
>来源：
> Bern C，Martin DL，Gilman RH。 急性和先天性锥虫病。 Adv Parasitol 2011; 75:19。
> Messenger LA，Gilman RH，Verastegui M等人。 改善特定环境下先天性锥虫病的早期诊断。 Clin Infect Dis 2017; 65：268。